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User-Level Workflow Design - A Bioinformatics Perspective

por Anna-Lena Lamprecht
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Anna-Lena Lamprecht User-Level Workflow Design - A Bioinformatics Perspective
Anna-Lena Lamprecht - User-Level Workflow Design - A Bioinformatics Perspective

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Descripción

The continuous trend in computer science to lift programming to higher abstraction levels increases scalability and opens programming to a wider public. In particular, service-oriented programming and the support of semantics-based frameworks make application development accessible to users with almost no programming expertise. This monograph establishes requirement-centric scientific workflow design as an instance of consequent constraint-driven development. Requirements formulated in terms of user-level constraints are automatically transformed into running applications using temporal logic-based synthesis technology. The impact of this approach is illustrated by applying it to four very different bioinformatics scenarios: phylogenetic analysis, the dedicated GeneFisher-P scenario, the FiatFlux-P scenario, and microarray data analyses.

Colaboradores

Autor:
Anna-Lena Lamprecht

Detalles de producto

Ilustraciones:
XXII, 223 p. 84 illus.
Indice:
The Bio-jETI Framework.- Phylogenetic Analysis Workflows.- GeneFisher-P.- FiatFlux-P.- Microarray Data Analysis Pipelines.
Observaciones:
The application of user-level workflow design makes the approach accessible to users with almost no programming expertise


Describes four realistic application scenarios in bioinformatics


Paves the way for a novel way of scientific workflow modeling based on jABC framework

Tipo de medio:
Tapa blanda
Editorial:
Springer Berlin
Idioma:
Inglés
Edición:
2013
Número de páginas:
223
Resumen:
This book discusses requirement-centric workflow design as an instance of consequent constraint-driven development, in four different scenarios: phylogenetic analysis, the dedicated GeneFisher-P scenario, the FiatFlux-P scenario, and microarray data analyses.

Datos base

Tipo de producto:
Libro de bolsillo
Fecha de aparición:
10 de diciembre de 2013
Dimensiones del paquete:
0.235 x 0.155 x 0.014 m; 0.454 kg
GTIN:
09783642453885
DUIN:
VII0D5I1RJM
51,08 €
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